Το Τμημα Ενταξης (Τ.Ε.) λειτουργεί ως υποστηρικτική δομή εκπαίδευσης για τους μαθητές και τις μαθήτριες με αναπηρία και ειδικές εκπαιδευτικές ανάγκες που φοιτούν στις σχολικές ομάδες όπως καθορίζονται από τον Ν.3699/2008, άρθρο 3, παρ. 1,2,3 και κατόπιν της σχετικής πρότασης των διαγνωστικών φορέων. Σκοπός του Τ.Ε. είναι η πλήρης ένταξη των μαθητών/μαθητριών στο σχολικό περιβάλλον μέσω της διαφοροποίησης των δραστηριοτήτων και των διδακτικών πρακτικών. Το Τ.Ε. δημιουργεί παρακαταθήκη για ένα σχολείο και η επιτυχία του βασίζεται στην ειλικρινή συνεργασία εκπαιδευτικών και γονέων.